Alpha, Delta et Now Omicron – Réponses à 6 questions importantes alors que les cas de COVID-19 augmentent dans le monde

« The Conversation » Note de l’éditeur : variable omicron À partir de SRAS-CoV-2virus qui provoque COVID-19[feminine, nourrir un Augmentation rapide des cas dans le monde. Nous avons demandé à une équipe de virologues et d’immunologistes de l’Université du Colorado à Boulder d’évaluer certaines des questions brûlantes que les gens se posent sur la nouvelle alternative.

En quoi omicron diffère-t-il des variantes précédentes ?

Il existe deux différences principales entre l’omicron et les variantes précédentes du virus SARS-CoV-2 apparues fin 2019. Les premières données suggèrent que les cas d’omicron sont plus doux des infections causées par la variable delta. D’un autre côté, omicron est plus transmissible – ce qui signifie qu’il se propage facilement – que les variantes précédentes. Il peut être déroutant de penser aux effets globaux d’un virus qui est beaucoup plus doux et aussi beaucoup plus contagieux.

Lorsque la variante delta est devenue courante et a changé d’alpha à l’été 2021, elle a pu le faire car elle était Entre 40 % et 60 % plus portable. Maintenant, la variable omicron est paire Plus transférable que delta.

Il est difficile de chiffrer la transmissibilité d’une variante plus intrinsèquement qu’une autre, car les comportements humains et les taux de vaccination sont en constante évolution. Ces facteurs, ainsi que la transmissibilité, influencent la façon dont le virus est transmis dans une population.

Par rapport à la souche originale de SARS-CoV-2, omicron contient 72 flèche dans tout le génome. Certaines de ces mutations expliquent les nouvelles caractéristiques complexes qui caractérisent cette variante. Nous décrivons ces changements dans la protéine de pointe, une protéine de surface importante qui permet au virus de se fixer et d’infecter les cellules. C’est aussi la principale caractéristique du virus que le système immunitaire humain reconnaît.

Pourquoi Omicron se propage-t-il si rapidement ?

Des études préliminaires indiquent qu’omicron est plus efficace pour la reproduction dans les voies respiratoires supérieures, y compris le nezEt gorge, Et Bouche, que les variantes précédentes, ce qui le rend plus similaire au virus du rhume. Si les données de ces études préliminaires corroborent, cela peut contribuer à expliquer la forte transmissibilité des omicrons : les virus se répliquent dans les voies respiratoires supérieures. Il peut se propager plus facilement, bien que les raisons de cela ne soient pas entièrement comprises.

De plus, l’omicron est souvent capable de échapper à l’immunité existante Assez longtemps pour que l’infection commence, provoque des symptômes et se transmette à la personne suivante. Cela explique la raison de la réinfection et le vaccin infections pénétrantes Il semble être plus courant avec omicron.

Omicron a un grand nombre de mutations et est plus transmissible que les variantes précédentes du SRAS-CoV-2.

Ces caractéristiques, et le moment où cette variante est apparue pendant la période des fêtes, ont entraîné une augmentation extraordinaire des infections au COVID-19 aux États-Unis ainsi que l’hiver – qui a ramené les gens à l’intérieur – ainsi que fatigue épidémique, et vous avez la tempête parfaite pour une transmission rapide.

La bonne nouvelle est que les vaccinations et les rappels de vaccins Fournit une bonne protection Contre les maladies graves et l’hospitalisation. Mais compte tenu du nombre actuel de cas, cela signifie encore beaucoup de maladies, d’hospitalisations et de décès dans les semaines à venir.

Un omicron pourrait-il rapprocher une population de l’immunité collective ?

immunité collective Cela se produit lorsqu’un nombre suffisant de personnes sont immunisées contre un virus qui ne se propage plus bien. Cela n’est possible que lorsque deux conditions sont remplies. Premièrement, une grande partie de la population doit être vaccinée ou se remettre d’une infection antérieure. Deuxièmement, une vaccination ou une infection antérieure doit conférer une immunité suffisante pour prévenir ou ralentir une infection future. Les campagnes de vaccination, combinées à la propagation de l’infection oomicron, suffiront-elles à vacciner le troupeau ?

Trois questions laissent espérer une immunité collective à long terme après Omicron. La première est que l’immunité diminue naturellement avec le temps, qu’elle ait été causée par un vaccin ou une infection antérieurs. On ne sait pas encore combien de temps après l’infection ou la vaccination contre ce virus persiste, car le SRAS-CoV-2 n’infecte les humains que depuis deux ans. A terme, des études contrôlées pourront le déterminer.

Deuxièmement, les enfants de moins de 5 ans ne sont pas encore éligibles aux vaccins COVID-19 et des enfants sensibles naissent chaque jour. Par conséquent, jusqu’à ce que tous les groupes d’âge soient éligibles à la vaccination, il est probable qu’il y ait une transmission continue chez les enfants.

Et troisièmement, nous ne pouvons pas exclure que de nouvelles variantes puissent échapper à l’immunité existante. comme j’ai montré omicronL’infection par une variante ne garantit pas la protection contre l’infection par de futures variantes.

Ensemble, ces trois facteurs suggèrent que même si une partie suffisamment importante de la population se remet d’omicron, une immunité collective à long terme est peu probable. Ce sont les mêmes raisons pour lesquelles les humains n’obtiennent jamais une immunité collective à long terme contre la grippe et doivent recevoir un nouveau vaccin contre la grippe chaque année.

Il est important de se rappeler qu’avec toutes les variables jusqu’à présent, la plupart des personnes qui ont été hospitalisées avec COVID-19 non vacciné. Cela montre que les vaccins sont un outil efficace pour réduire la gravité de la maladie et peuvent être bénéfiques même contre de nouvelles variantes.

D’où viennent les nouvelles variantes comme Omicron ?

Lorsque les virus font plus de copies d’eux-mêmes à l’intérieur des cellules humaines, ils commettent des erreurs dans ce processus – des mutations – qui modifient leur code génétique. La plupart de ces mutations ne seront pas bénéfiques pour le virus. Cependant, dans certains cas, le virus touche le gros lot d’une ou plusieurs mutations bénéfiques qui alimentent sa propagation dans la population. La variante alpha a quelques mutations dans la protéine de pointe qu’elle a fabriquée Plus facile pour les virus d’infecter les cellules. La variante delta contient des mutations supplémentaires La propagation du virus s’est améliorée. Omicron, avec son nombre impressionnant de mutations, est vraiment étrange. Il est rare que le coronavirus accumule rapidement autant de mutations dans son génome.

Les origines d’Omicron ne sont pas encore bien comprises. Une théorie qui prévaut est qu’une personne immunodéprimée a contracté le coronavirus pour Une période de temps prolongée, Conduit à Évolution virale accélérée. Une autre théorie On suppose que l’omicron aurait pu évoluer dans d’autres espèces animales, puis infecter à nouveau les humains. Alternativement, l’omicron aurait pu progressivement évoluer vers un site médiocre Séquence de surveillance. Il reste encore beaucoup à comprendre sur les facteurs qui ont conduit à l’émergence de cette variante hautement mutée.

L’omicron pourrait-il muter pour être plus mortel ?

Les variantes qui sont apparues l’ont fait parce qu’elles contenaient des mutations bénéfiques du coronavirus. Nous assistons essentiellement à l’évolution darwinienne – la survie du plus apte – en temps réel. Les variantes avec des mutations bénéfiques, telles que celles qui permettent une fuite des anticorps ou des temps d’incubation plus courts, remplacent rapidement leurs prédécesseurs moins adaptés.

La chose la plus importante à retenir sur l’évolution des virus est que la sélection naturelle favorise les variantes qui se propagent mieux que les autres espèces. La bonne nouvelle est que les variantes plus pathogènes – ou dangereuses – sont moins susceptibles de bien se propager. En effet, les personnes qui se sentent particulièrement malades ont tendance à s’isoler naturellement, ce qui réduit le risque de transmission du virus.

La bonne nouvelle est aussi que, parce que l’infection est une variable Fournit une immunité partielle aux autres, la diffusion rapide d’omicron a conduit au déclin rapide de delta.

À ce stade, on s’attend à ce que toutes les nouvelles variantes se généralisent – les soi-disant variables inquiétantes – Il continuera à être hautement transmissible.

Qu’en est-il du battage médiatique autour de « deltacron » et « flurona » ?

Début janvier 2022, des chercheurs chypriotes ont signalé des cas de virus COVID-19 contenant séquences omicron et delta ., surnommé « deltacron ». Cependant, d’autres chercheurs pensent qu’il ne s’agit que d’un fichier contaminants de laboratoire Un échantillon d’omicron contaminé par du delta. Bien que plus de détails soient nécessaires, pour l’instant, il n’y a aucune raison de s’inquiéter de cet hybride potentiel car il n’a pas été si couramment observé.

Et ces dernières semaines Le terme « Florona » est apparu, faisant référence à une personne infectée à la fois par le virus de la grippe et le virus Corona. Bien que rares, de telles situations se produisent, et il est important que vous réduisiez votre risque en recevant le vaccin contre la grippe et la COVID-19. Mais il est important de noter que Florona n’est pas un nouveau mélange des génomes de la grippe et du coronavirus, ce qui rend le terme quelque peu impropre.

écrit par:

• Sarah Sawyer est professeur de biologie moléculaire, cellulaire et du développement à l’Université du Colorado à Boulder
• Arturo Barbaciano Guerrero – Chercheur postdoctoral en virologie, Université du Colorado à Boulder
• Cody Warren – Chercheur postdoctoral en virologie et immunologie, Université du Colorado à Boulder

Cet article a été publié pour la première fois dans Conversation.