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Un nouveau type de coronavirus détecté en Afrique du Sud alors que les cas augmentent

Andrew Melderm et Mogomotsi Magumi, Associated Press

Publié le jeudi 25 novembre 2021 à 14h58 HNE

Jeudi, le ministre de la Santé Joe Vahla a annoncé la découverte d’un nouveau type de coronavirus en Afrique du Sud, qui, selon les scientifiques, est préoccupant en raison du nombre élevé de mutations et de sa propagation rapide chez les jeunes du Gauteng, la province la plus peuplée du pays. .

Le virus Corona évolue au fur et à mesure qu’il se propage et de nombreuses nouvelles variantes, y compris celles présentant des mutations inquiétantes, meurent souvent. Les scientifiques surveillent les changements potentiels qui pourraient être plus transmissibles ou mortels, mais déterminer si de nouvelles variables auront un impact sur la santé publique peut prendre du temps.

Lors d’une conférence de presse en ligne, Bhalla a déclaré que l’Afrique du Sud avait connu une augmentation du nombre de nouvelles infections.

« Au cours des quatre ou cinq derniers jours, il y a eu une augmentation plus exponentielle », a-t-il déclaré, ajoutant que la nouvelle variante semble être à l’origine de l’augmentation des cas. Des scientifiques d’Afrique du Sud s’efforcent de déterminer le pourcentage de nouveaux cas causés par la nouvelle variante.

Il a déclaré que la nouvelle variante, actuellement identifiée sous le nom de B.1.1.529, avait également été trouvée au Botswana et à Hong Kong chez des voyageurs sud-africains.

Le groupe de travail technique de l’Organisation mondiale de la santé se réunira vendredi pour évaluer la nouvelle alternative et pourrait décider de la nommer ou non à partir de l’alphabet grec.

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La nouvelle variante contient une « constellation » de nouvelles mutations, a déclaré Tulio de Oliveira, du réseau sud-africain de surveillance du génome, qui a suivi la propagation de la variante delta dans le pays.

« Le très grand nombre de mutations est une préoccupation pour l’évasion immunitaire et la transmissibilité attendues », a déclaré de Oliveira.

« Cette nouvelle variante a de très nombreuses mutations », dont plus de 30 à la protéine squelettique qui affecte la transmissibilité, a-t-il déclaré. « Nous pouvons voir que la variante a le potentiel de se propager très rapidement. Nous prévoyons de commencer à voir une pression dans le système de santé dans les prochains jours et semaines. »

De Oliveira a déclaré qu’une équipe de scientifiques de sept universités sud-africaines étudiait l’alternative. Il a dit qu’ils en avaient 100 génomes complets et qu’ils s’attendaient à en avoir plus dans les prochains jours.

« Nous sommes préoccupés par le bond dans le développement de cette alternative », a-t-il déclaré. La seule bonne nouvelle, a-t-il dit, est qu’il peut être détecté avec un test PCR.

Après une période de transmission relativement faible où l’Afrique du Sud a enregistré un peu plus de 200 nouveaux cas confirmés par jour, la semaine dernière, les nouveaux cas quotidiens ont rapidement augmenté pour atteindre plus de 1 200 mercredi. Jeudi, ils ont bondi à 2465.

Le ministre de la Santé Bahla a déclaré que la première augmentation s’était produite à Pretoria et dans la région métropolitaine de Twane environnante, et semblait être des épidémies de grappes provenant de rassemblements d’étudiants dans les universités de la région. Au milieu des cas croissants, les scientifiques ont étudié la séquence génétique et découvert la nouvelle variante.

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« C’est clairement une variable sur laquelle nous devons être très sérieux », a déclaré Ravindra Gupta, professeur de microbiologie clinique à l’Université de Cambridge. « Il a un grand nombre de mutations soudaines qui peuvent affecter la transmissibilité et la réponse immunitaire. »

Gupta a déclaré que les scientifiques d’Afrique du Sud ont besoin de temps pour déterminer si l’augmentation des nouveaux cas est attribuable à la nouvelle variante. « Il y a une forte probabilité que ce soit le cas », a-t-il déclaré. « Les scientifiques sud-africains ont fait un travail incroyable pour identifier rapidement cela et le porter à l’attention du monde. »

Bhalla a déclaré que les responsables sud-africains avaient averti de s’attendre à une résurgence de la mi-décembre au début de janvier et avaient espéré s’y préparer en vaccinant davantage de personnes.

Environ 41 % des adultes en Afrique du Sud ont été vaccinés et le nombre d’injections administrées par jour est relativement faible, à moins de 130 000, bien en deçà de l’objectif du gouvernement de 300 000 par jour.

L’Afrique du Sud dispose actuellement d’environ 16,5 millions de doses de vaccins, en Pfizer et Johnson & Johnson, dans le pays et prévoit de livrer environ 2,5 millions de plus la semaine prochaine, selon Nicholas Crisp, directeur général par intérim du Département national de la santé.

« Nous obtenons des vaccins plus rapidement que nous ne les utilisons actuellement », a déclaré Crisp. « Donc, depuis un certain temps maintenant, nous retardons les livraisons, ne réduisons pas les commandes, mais retardons simplement nos livraisons afin de ne pas collecter et stocker de vaccins. »

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L’Afrique du Sud, avec une population de 60 millions d’habitants, a enregistré plus de 2,9 millions de cas de COVID-19 dont plus de 89 000 décès.

À ce jour, la variante delta reste la plus contagieuse et a évincé d’autres variantes auparavant inquiétantes, notamment alpha, bêta et mu. Selon les séquences soumises par les pays du monde entier à la plus grande base de données publique au monde, plus de 99% sont des deltas.