février 8, 2023

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Une mutation génétique rend une nouvelle variante hautement contagieuse – Rolling Stone

il y a du nouveau, La forme la plus contagieuse de coronavirus nouveau. Il a une plus grande capacité à échapper à nos anticorps. Et il se propage plus facilement que jamais.

Vous avez déjà lu ces mots et vous les relirez presque certainement alors que la pandémie de Covid entre dans sa quatrième année. Mais faites attention, car il y a quelque chose de nouveau à propos de XBB.1.5, également connu sous le nom de Kraken, le dernier Omicron variante qui est rapidement devenue la forme dominante du SRAS-CoV-2 dans la plupart des régions du monde. XBB.1.5 a évolué après quelques grand Rebondissements génétiques.

Le virus a encore le pouvoir de nous surprendre. Et cela ne peut signifier qu’une chose : « Il semble que le SRAS-CoV-2 sera avec nous pendant longtemps », déclare Matthew Freeman, immunologiste et microbiologiste à la faculté de médecine de l’Université du Maryland.

Le Kraken présente une mutation majeure que les généticiens ont nommée « F486P ». Il semble s’agir d’un léger changement dans la protéine de pointe, une partie du virus qui l’aide à saisir et à infecter nos cellules. Le F486P agit en améliorant la capacité de la pointe à se « lier » à une partie spécifique de nos cellules appelée récepteur ACE2. Ce petit changement a des implications énormes. Le F486P permet à XBB.1.5 de conserver tous les traits les plus critiques des sous-variantes d’origine, tout en ajoutant un élément le nouveau Qualité : hautement transmissible.

Essentiellement, le F486P rend XBB.1.5 vraiment contagieux – bien plus contagieux que ses prédécesseurs immédiats. Mais il a aussi hérité de ces mêmes ancêtres la troublante possibilité d’échapper à nos propres anticorps. « En raison de la mutation de pointe F486P, XBB.1.5 montre une affinité de liaison au récepteur viral beaucoup plus élevée… tout en conservant un évitement d’anticorps similaire. » [properties] », explique Lihong Liu, chercheur sur le Covid-19 à l’Université de Columbia. En bref, XBB.1.5 est la première variante de sa famille immédiate à être plus insaisissable sur le plan immunogène. Et plus contagieux.

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L’émergence de la mutation F486P rappelle que même si de nombreuses personnes poursuivent leur vie, la pandémie n’est pas près de se terminer. Le virus continue de trouver des moyens de se propager plus rapidement alors qu’il se glisse de plus en plus à travers tous ces anticorps que nous avons créés à partir de vaccins, de rappels et d’infections précédents.

XBB.1.5 est apparu pour la première fois dans des échantillons viraux dans le nord-est des États-Unis en octobre. Au bout de deux mois, il est présent dans près de 30 pays, et selon dernière projection Selon les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis, il pourrait en effet s’agir de la forme dominante de Covid aux États-Unis. Ce n’est pas un hasard s’il y a eu un pic de cas graves de Covid dans le nord-est des États-Unis, le lieu de naissance de XBB.1.5 et la zone où l’air est le plus épais.

Nous avons déjà vécu ce genre de choses, bien sûr. Certaines nouvelles sous-variantes se développent, deviennent dominantes et entraînent une augmentation des cas. Mais pour l’instant, la plupart des gens dans la plupart des pays ont un mélange sain d’anticorps Covid provenant de vaccins, d’infections antérieures ou des deux. Ainsi, alors que les taux d’infection augmentent et diminuent au rythme de l’évolution virale, les hospitalisations et les décès ont tendance à baisser dans la plupart des régions du monde depuis plusieurs mois maintenant.

Il n’y a aucune raison de s’attendre à ce que XBB.1.5 modifie cette dynamique de manière significative. Malgré toutes ses nouvelles rides génétiques, il est toujours un Omicron. Et entre les vaccins et les rappels et l’immunité contre les infections passées, nous avons de nombreuses façons de nous protéger contre cette espèce particulière et sa progéniture.

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S’il y a une grande exception, c’est la Chine, où un verrouillage de trois ans a finalement commencé début décembre après de nombreuses manifestations publiques. Maintenant, le système de santé chinois vacille sous la première grande épidémie de Covid du pays. Notamment, XBB.1.5 n’est pas apparu en Chine. Jusqu’ici.

La plupart du monde est très bien placé pour lutter avec XBB.1.5. La Chine ne l’est pas. Pour les centaines de millions de Chinois immunodéprimés, les rebondissements évolutifs du COVID sont inquiétants.

J’ai commencé avec BA.2 et BA.2.75, deux des premières sous-variantes d’Omicron qui étaient populaires dans plusieurs pays au printemps et à l’été derniers, respectivement. À un moment donné, quelqu’un – ou plusieurs personnes – qui ont récupéré de BA.2 ont été infectés par BA.2.75, ou vice versa. Ces deux formes de virus se sont recombinées dans ces hôtes, produisant le XBB « recombinant », qui a ensuite évolué en XBB.1 puis en XBB.1.5.

Peter Hotez, un expert en développement de vaccins au Baylor College, appelle ces variantes recombinantes « Scrabble ». « Parce qu’ils ont tendance à utiliser des lettres de Scrabble de grande valeur comme X, B et Q. » Ce qu’ils ont tous en commun, dit Hotez, c’est qu’ils sont « des variantes d’échappement du domaine de liaison aux récepteurs ».

En clair, ils ont des protéines de pointe collantes Et Ils sont vraiment bons pour repousser les anticorps, en particulier les anticorps que nous obtenons des vaccins. « À ma connaissance, XBB.1, le parent de XBB.1.5, est presque complètement résistant à l’immunité humorale induite par le vaccin », déclare Kei Sato, virologue à l’Université de Tokyo.

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Mais XBB.1.5 est plus stable Et plus insaisissable. Et tout cela à cause de la mutation F486P. Le XBB original et son descendant direct comprenaient le XBB.1 F486S au lieu de F486P. F486S a changé la protéine de pointe, cependant il n’a pas fait Ils rendent la Spike Protein plus visqueuse et donc plus transmissible.

Avec F486P, XBB et XBB.1 ont atteint une plus grande évasion immunitaire sans pour autant Il ajoute également une plus grande portabilité. Ensuite, XBB.1.5 a résisté à cette tendance ergonomique. La mise à niveau de la mutation, de F486S à F486P, a rendu la protéine de pointe plus collante et le virus plus transmissible.

commun

Pour la plupart d’entre nous, c’est cette innovation génétique qui est la plus troublante pour la direction qu’elle pointe. Il y a eu des spéculations au début de 2021 – à peine six mois environ après le début de la pandémie – selon lesquelles le SRAS-CoV-2 manquerait d’espace génomique, pour ainsi dire, et cesserait de muter de manière significative.

Cela ne s’est pas produit. « Il semble encore y avoir plus de place pour les mutations dans le génome », déclare Freeman. XBB.1.5 est la preuve que le virus peut encore changer, restant plus contagieux et plus insaisissable. Qu’il pouvait, après tout ce temps, nous surprendre.