Les variantes de Nightmare Omicron COVID déchiffrent le code de notre système immunitaire

Vous ne le savez peut-être pas en regardant autour de vous tous ces visages non masqués, mais il y en a encore beaucoup coronavirus nouveau À l’étranger. Et le virus semble muter plus rapidement que jamais auparavant, produisant régulièrement Variantes et sous-variables infectieuses.

La tendance évolutive avec le SRAS-CoV-2 ne signifie peut-être pas qu’il y aura certainement une augmentation significative des infections, des hospitalisations et des décès. Du moins pas partout ou pour très longtemps.

Mais cela souligne un fait inconfortable : que malgré la levée des restrictions COVID dans la plupart des pays Ce n’est pas si Chine, Bien que de nombreuses personnes aient été impatientes de surmonter la douleur et l’incertitude au cours des deux dernières années, la pandémie est loin d’être terminée. Le virus n’a pas fini de muter.

Les sous-variables les plus récentes sont les plus portables à ce jour. BA.4 et BA.5, tous deux descendants de la variante Omicron, Il est apparu pour la première fois en Afrique du Sud le mois passé. BA.2.12 et BA.2.12.1 connexe Apparu pour la première fois à New York Autour du même moment.

BA.4 et BA.5 sont 10% plus contagieux De son prédécesseur direct, BA.2 est un format Omicron. BA.2.12 et BA.2.12.1 sont 25 % plus sensibles. Il est également préoccupant que BA.4, BA.5, BA.2.12 et B.2.12.1 soient rapidement devenus dominants dans leurs régions respectives après seulement deux mois de domination de BA.2. BA.2 a concouru pour sa part et a remplacé sa maison mère, BA.1, quelques mois après la prise de contrôle de BA.1.

En d’autres termes, de nouvelles sous-variables majeures semblent nous arriver de plus en plus vite. En ce sens, le virus pourrait avoir l’air de gagner un jeu de fortune génétique. Confronté à une barrière semi-perméable aux anticorps des précédents vaccins et infections, l’agent pathogène est devenu plus transmissible.

Edwin Michael, épidémiologiste au Center for Infectious Disease Research in Global Health de l’Université de Floride du Sud, a déclaré au Daily Beast que le stress immunitaire « augmenterait la vitesse à laquelle ces variantes sont sélectionnées de manière plus appropriée et qui circulent déjà dans la population ». « Cela se traduira par des cascades de nouvelles variantes apparaissant et se propageant plus fréquemment dans la population hôte. »

Mais cette série de variables est un prix que nous payons pour notre immunité élargie au niveau de la population. Vous ne pouvez pas avoir ce dernier sans obtenir certains des premiers. Ainsi, alors que COVID peut sembler être le vainqueur, en réalité ses triomphes génétiques peuvent être éphémères.

Nima Moshiri, généticienne à l’Université de Californie à San Diego, a exhorté The Daily Beast l’année dernière à considérer chaque infection COVID comme un joueur de machine à sous. Moshiri a expliqué que chaque infection individuelle a tendance à provoquer deux pics toutes les deux semaines. En d’autres termes, le virus reçoit deux intensités du levier deux fois par mois, dans l’espoir d’un prix génétique qui lui donne un nouvel avantage sur les autres virus – et une nouvelle façon d’infecter son hôte.

« Et si 50 millions de personnes actionnaient les manettes des machines à sous en même temps ? » demanda Moshiri. « Nous nous attendons à ce qu’au moins une personne remporte le jackpot très rapidement. Maintenant, remplacez la machine à sous par une ‘mutation SARS-CoV-2 cliniquement significative’, et c’est la situation dans laquelle nous nous trouvons. »

Pour compléter la métaphore, ajoutez un sentiment d’urgence accru de la part du virus alors que l’immunité se profile plus haut tout autour de lui. Sentant les menaces tout autour de lui, le nouveau coronavirus joue les écoutilles avec une détermination plus sombre que jamais.

tout au long de Vagues virales et effondrements Au cours des 30 derniers mois, il n’y a jamais eu moins de plusieurs millions de cas actifs de COVID. Au pire des augmentations soudaines au début de 2021 et au début de 2022, il y a eu des dizaines de millions d’infections simultanées. Compte tenu du taux élevé auquel le SRAS-CoV-2 mute, il n’est pas étonnant que le virus ait produit une série constante de nouvelles variantes importantes – la «lignée» étant le terme scientifique.

Il y avait Delta, la souche la plus virulente qui a conduit aux pires vagues d’infections en 2021 alors qu’une grande partie du monde commençait tout juste à avoir accès à des traitements et des vaccins efficaces. Fin 2022, des scientifiques du Botswana et d’Afrique du Sud ont découvert les premiers cas d’une nouvelle souche, Omicron.

Les mutations le long de la protéine de pointe, qui fait partie du virus qui l’aide à saisir et à infecter nos cellules, rendent l’omicron plus infectieux que le delta. Le pire jour de la vague Omicron, le 19 janvier, les autorités ont dénombré au moins 4 millions de nouvelles infections en seulement 24 heures. C’est quatre fois plus que le nombre de cas recensés lors des pires jours d’ondes delta consécutives en janvier et avril 2021.

Une forte absorption universelle du vaccin, combinée à des anticorps persistants chez des dizaines de millions de personnes en raison d’infections antérieures, a atténué les pires résultats d’Omicron. Lorsque Omicron est apparu pour la première fois, environ la moitié des 8 milliards de personnes dans le monde ont reçu au moins une dose du vaccin. Aujourd’hui, plus des deux tiers d’entre eux subissent des coups de couteau au moins partiels.

Ajoutez à cela des anticorps naturels provenant de centaines de millions d’infections antérieures, et le mur immunitaire de la race humaine serait impressionnant. Les infections pénétrantes sont courantes, mais tous ces anticorps sont vraiment efficaces pour empêcher le virus de provoquer une maladie grave pouvant entraîner la mort.

Les cas ont donc monté en flèche avec Omicron devenant dominant, mais pas les décès. Le jour le plus meurtrier de l’éruption d’Omicron le 9 février, 13 000 personnes sont mortes dans le monde – 5 000 de moins que celles qui sont mortes le pire jour du delta le 20 janvier 2021.

Plus de cas mais moins de décès, un phénomène que les épidémiologistes appellent « découplage », est venu définir l’évolution du COVID alors que nous trébuchons au cours de la troisième année de la pandémie. Il y a des signes que la classe peut devenir plus extrême. Après tout, l’immunité qui mène à la séparation aussi Il stimule le virus à muter plus rapidement en des souches plus transmissibles.

Les mutations sont stimulées par l’immunité, qui peut augmenter l’immunité en diffusant les anticorps d’une infection bénigne. C’est une boucle de rétroaction positive accélérée dont les produits sont des anticorps et des souches virales.

L’écart croissant entre l’infection et la mortalité peut en fait être le meilleur scénario, le nouveau coronavirus étant miraculeusement absent de « l’auto-extinction » en tombant dans le coin génétique. De nombreux experts croient fermement que l’impasse évolutive est un vœu pieux en ce qui concerne les virus respiratoires. « Je pense que l’auto-extinction est absolument improbable », a déclaré Jesse Bloom, chercheur au Fred Hutchinson Cancer Research Center dans l’État de Washington, au Daily Beast.

La mauvaise nouvelle est que nous devrons peut-être apprendre à faire face aux variantes et sous-variantes plus infectieuses du SRAS-CoV-2 qui émergent de plus en plus rapidement. La bonne nouvelle est que nous savons comment aux jumeaux. BA.4, BA.5, BA.2.12 et BA.2.12.1 ont une certaine capacité à contourner les anticorps naturels induits par le vaccin – « l’évasion immunitaire », comme l’appellent les experts.

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Une certaine évasion immunitaire ne signifie pas une évasion immunitaire complète. Les anticorps naturels et les vaccins fonctionnent toujours. Ils sont la cause de la séparation des cas et des décès de la souche primaire Omicron. Ils sont la raison pour laquelle vous pourriez aussi être séparé de la mauvaise petite progéniture d’Omicron. « Les mutations ne semblent pas être aussi pathogènes que delta », a déclaré Stephanie James, responsable du laboratoire de test COVID à l’Université Regis du Colorado, au Daily Beast.

Tout cela signifie, attendez-vous à entendre beaucoup parler de nouvelles lignées et sous-lignées dans les mois à venir à mesure qu’elles émergent et deviennent dominantes à un rythme accéléré. Ne soyez pas surpris si vous en attrapez un, même si vous avez été vacciné et boosté et que vous avez peut-être même des anticorps d’une infection antérieure.

Mais ne paniquez pas. Continuez vos vaccinations et tout ira probablement bien.

À moins, bien sûr, que l’évolution du SRAS-CoV-2 ne prenne une tournure dangereuse. L’évasion immunitaire a été très simple avec toutes les lignées et sous-lignées majeures que nous avons vues au cours des deux dernières années. Cela ne signifie pas que le virus ne peut pas évoluer pour atteindre une évasion immunitaire significative. Si les mutations sont comme des créneaux pathogènes et que le jackpot est une nouvelle espèce, une alternative qui peut pirater nos anticorps est le jackpot.

Si jamais le virus gagne qui – lequel Gamble, tout change.