La recherche, dirigée par des scientifiques du Big Data Institute de l’Université d’Oxford, combine des génomes humains provenant de diverses sources – à la fois l’ADN ancien et moderne – pour mieux comprendre l’histoire et le développement humains.
Tout comme un arbre généalogique montre comment un individu est lié à ses parents ou à ses frères et sœurs, il est héréditaire L’auteur principal Anthony Wilder Wons, maintenant chercheur postdoctoral au Broad Institute du MIT et de Harvard, a déclaré à CNN que la généalogie révèle les gènes que deux personnes ont en commun.
En tant que tel, il peut montrer quels points du génome humain partagent des gènes et où ils diffèrent.
« En termes simples, ce que nous avons fait, c’est que nous avons créé le plus grand arbre généalogique humain de tous les temps », a déclaré Wons. « Nous avons une seule lignée qui retrace les ancêtres de toute l’humanité et montre comment nous sommes tous liés les uns aux autres aujourd’hui. »
Une ressource signifie que toute personne ayant accès à ses informations génétiques peut savoir quand ses ancêtres se sont déplacés vers un endroit particulier et pourquoi ils ont certains gènes.
« Il s’agit essentiellement de comprendre toute l’histoire de l’histoire humaine écrite dans nos gènes », a déclaré Wohns.
Cependant, il s’est avéré difficile de combiner différentes bases de données, de fusionner des génomes anciens et modernes et de trouver des moyens de traiter une si grande quantité de données.
L’équipe d’Oxford a développé des algorithmes pour permettre l’incorporation du génome dans leur outil.
« C’était l’une de nos plus grandes innovations », a déclaré Wons.
Cela, a-t-il dit, leur a permis de construire la structure de ce qu’ils ont appelé la « généalogie génétique humaine » dont on parlait théoriquement depuis près de 30 ans.
« Nous essayons essentiellement de percer le voile et de voir à quoi cela ressemble », a-t-il ajouté.
Dans l’état actuel des choses, les gènes de 3 609 personnes ont été séquencés à partir de 215 groupes, certains datant de plus de 100 000 ans. Cette méthode permet d’étendre ce nombre à des millions de génomes dans le futur.
Le document confirme les conclusions actuelles sur l’histoire humaine, y compris que la plupart de l’évolution humaine s’est produite en Afrique avant grand Wohns a déclaré que le mouvement hors du continent remonte à environ 70 000 ans.
« C’est une confirmation à bien des égards », a-t-il déclaré, ajoutant que les données montrent qu’il existe la plus grande diversité génétique en Afrique et que les plus anciens ancêtres humains se trouvent sur le continent. « Il est clair que la majorité de l’évolution humaine s’est produite en Afrique. »
« Premier projet » de généalogie génétique
Cependant, les données soulèvent également des questions.
« Cela suggère des migrations inconnues qui se sont produites dans le passé », a déclaré Wons.
Par exemple, il existe des preuves que les ancêtres humains étaient en Amérique du Nord plus tôt qu’on ne le pensait, bien que des recherches supplémentaires soient nécessaires pour découvrir des migrations inconnues, a-t-il déclaré.
Wens a comparé la recherche à une « première ébauche » de la généalogie génétique humaine, et a déclaré que davantage de travail aiderait à la rendre plus précise et complète.
L’ajout de plus de génomes aidera à le faire, mais pour atteindre une précision totale, nous devons obtenir le génome de chaque être humain qui a jamais vécu, a-t-il dit, ce qui n’est pas possible.
Wohns a déclaré qu’il espère que d’autres chercheurs dans le domaine utiliseront la ressource, qui est disponible en téléchargement avec des instructions d’utilisation, comme base pour répondre à des questions plus spécifiques sur la migration dans certaines zones géographiques.
« Ce sera une ressource très riche pour les futures enquêtes sur l’histoire de l’évolution humaine », a-t-il déclaré.
Wons lui-même travaille avec des chercheurs en IA pour essayer d’obtenir des estimations plus précises de quand et où vivaient les ancêtres humains.
La méthode peut également être utilisée pour développer la généalogie de tout organisme, y compris des maladies telles que le SRAS-CoV-2, le coronavirus qui cause le Covid-19, et Wohns prévoit d’étudier la relation entre la génétique et la maladie.
La «grande promesse» des études évolutionnistes
Anders Bergstrom, chercheur postdoctoral en génomique évolutive au Francis Crick Institute de Londres, a déclaré à CNN que l’étude fournit une nouvelle façon d’estimer la relation entre notre ADN.
« Inférer des lignées arborescentes reliant l’ADN entre différentes personnes est le Saint Graal de la génomique. Cela ne sera jamais complètement résolu, mais cette nouvelle méthode de calcul fait un pas en avant important sur ce problème », a-t-il déclaré par e-mail.
« La généalogie qu’ils en déduisent fournit un aperçu incroyablement riche de la diversité et de l’histoire génétiques humaines. Il y a beaucoup d’enthousiasme dans la génomique à propos des nombreuses possibilités offertes par ces nouvelles approches informatiques. »
Pontus Skoglund, chef de groupe de l’Ancient Genome Laboratory du Francis Crick Institute, a déclaré à CNN que l’étude montre que ce type d’approche peut s’étendre à de grandes bases de données.
« Ils ont donc une grande promesse d’avantages pour la génétique médicale et les études évolutives, et cet article est un énorme pas en avant vers cela », a déclaré Skoglund par e-mail.
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